MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL840

Total Repeats: 1585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011311	T	6	6	77821	77826	0 %	100 %	0 %	0 %	215778417
1502	NC_011311	T	6	6	77853	77858	0 %	100 %	0 %	0 %	215778417
1503	NC_011311	GGT	2	6	77916	77921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215778417
1504	NC_011311	CTT	2	6	78843	78848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778418
1505	NC_011311	AACG	2	8	78951	78958	50 %	0 %	25 %	25 %	215778418
1506	NC_011311	AGA	2	6	78972	78977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778418
1507	NC_011311	AGGC	2	8	78999	79006	25 %	0 %	50 %	25 %	215778418
1508	NC_011311	AC	4	8	79037	79044	50 %	0 %	0 %	50 %	215778418
1509	NC_011311	TCT	2	6	79145	79150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778418
1510	NC_011311	ATG	2	6	79232	79237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778418
1511	NC_011311	TCG	2	6	79261	79266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778418
1512	NC_011311	GAT	2	6	79326	79331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778418
1513	NC_011311	CG	3	6	79361	79366	0 %	0 %	50 %	50 %	215778418
1514	NC_011311	ACG	2	6	79408	79413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778418
1515	NC_011311	TCT	2	6	79460	79465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778418
1516	NC_011311	T	6	6	79543	79548	0 %	100 %	0 %	0 %	215778418
1517	NC_011311	CA	3	6	79606	79611	50 %	0 %	0 %	50 %	215778418
1518	NC_011311	AATG	2	8	80288	80295	50 %	25 %	25 %	0 %	215778419
1519	NC_011311	GAA	2	6	80318	80323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778419
1520	NC_011311	ATT	2	6	80324	80329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778419
1521	NC_011311	T	6	6	80362	80367	0 %	100 %	0 %	0 %	215778419
1522	NC_011311	TAT	2	6	80500	80505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778419
1523	NC_011311	C	6	6	80572	80577	0 %	0 %	0 %	100 %	215778420
1524	NC_011311	CCA	2	6	80622	80627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778420
1525	NC_011311	T	6	6	80668	80673	0 %	100 %	0 %	0 %	215778420
1526	NC_011311	CTT	2	6	80694	80699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778420
1527	NC_011311	TCA	2	6	80700	80705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778420
1528	NC_011311	T	7	7	80748	80754	0 %	100 %	0 %	0 %	215778420
1529	NC_011311	ACC	2	6	80776	80781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778420
1530	NC_011311	GATA	2	8	80797	80804	50 %	25 %	25 %	0 %	215778420
1531	NC_011311	ATGCCA	2	12	80820	80831	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	215778420
1532	NC_011311	TTGC	2	8	80838	80845	0 %	50 %	25 %	25 %	215778420
1533	NC_011311	ATT	2	6	80869	80874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778420
1534	NC_011311	TAGT	2	8	80882	80889	25 %	50 %	25 %	0 %	215778420
1535	NC_011311	TTCA	2	8	80938	80945	25 %	50 %	0 %	25 %	215778420
1536	NC_011311	T	6	6	80965	80970	0 %	100 %	0 %	0 %	215778420
1537	NC_011311	TAA	2	6	80988	80993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778420
1538	NC_011311	A	6	6	80992	80997	100 %	0 %	0 %	0 %	215778420
1539	NC_011311	TTC	2	6	81019	81024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778420
1540	NC_011311	TTA	2	6	81041	81046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778420
1541	NC_011311	TAT	2	6	81064	81069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778420
1542	NC_011311	A	7	7	81139	81145	100 %	0 %	0 %	0 %	215778420
1543	NC_011311	AACT	2	8	81154	81161	50 %	25 %	0 %	25 %	215778420
1544	NC_011311	AGAT	2	8	81184	81191	50 %	25 %	25 %	0 %	215778420
1545	NC_011311	TTA	2	6	81192	81197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778420
1546	NC_011311	ATT	2	6	81221	81226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778420
1547	NC_011311	TTA	2	6	81323	81328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778421
1548	NC_011311	T	6	6	81336	81341	0 %	100 %	0 %	0 %	215778421
1549	NC_011311	AATCA	2	10	81357	81366	60 %	20 %	0 %	20 %	215778421
1550	NC_011311	TTA	2	6	81400	81405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778421
1551	NC_011311	CTAA	2	8	81475	81482	50 %	25 %	0 %	25 %	215778421
1552	NC_011311	ATG	2	6	81530	81535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778421
1553	NC_011311	TTG	2	6	81537	81542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778421
1554	NC_011311	ACA	2	6	81592	81597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778421
1555	NC_011311	GTTT	2	8	81620	81627	0 %	75 %	25 %	0 %	215778421
1556	NC_011311	ATA	2	6	81634	81639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778421
1557	NC_011311	AAT	2	6	81699	81704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778421
1558	NC_011311	ACAA	2	8	81732	81739	75 %	0 %	0 %	25 %	215778421
1559	NC_011311	AAT	2	6	81777	81782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778421
1560	NC_011311	TAA	2	6	81860	81865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778421
1561	NC_011311	T	6	6	81889	81894	0 %	100 %	0 %	0 %	215778421
1562	NC_011311	AAG	2	6	81929	81934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778421
1563	NC_011311	TCA	2	6	82045	82050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778421
1564	NC_011311	CAT	2	6	82076	82081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778421
1565	NC_011311	TCA	2	6	82175	82180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778421
1566	NC_011311	A	8	8	82204	82211	100 %	0 %	0 %	0 %	215778421
1567	NC_011311	ATTA	2	8	82243	82250	50 %	50 %	0 %	0 %	215778421
1568	NC_011311	AATT	2	8	82259	82266	50 %	50 %	0 %	0 %	215778422
1569	NC_011311	ATACAT	2	12	82289	82300	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	215778422
1570	NC_011311	CAC	2	6	82339	82344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778422
1571	NC_011311	TTTA	2	8	82526	82533	25 %	75 %	0 %	0 %	215778422
1572	NC_011311	TCC	2	6	82618	82623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215778422
1573	NC_011311	AAT	2	6	82643	82648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778422
1574	NC_011311	CTTT	2	8	82657	82664	0 %	75 %	0 %	25 %	215778422
1575	NC_011311	TA	3	6	82708	82713	50 %	50 %	0 %	0 %	215778422
1576	NC_011311	ACA	2	6	82725	82730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778422
1577	NC_011311	ATT	2	6	82757	82762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778422
1578	NC_011311	ATA	2	6	82913	82918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778422
1579	NC_011311	TTGATT	2	12	82937	82948	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	215778422
1580	NC_011311	ATA	2	6	82956	82961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778422
1581	NC_011311	TATAT	2	10	83021	83030	40 %	60 %	0 %	0 %	215778422
1582	NC_011311	AACAAA	2	12	83156	83167	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	215778422
1583	NC_011311	AAT	2	6	83264	83269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778422
1584	NC_011311	A	7	7	83341	83347	100 %	0 %	0 %	0 %	215778422
1585	NC_011311	GTT	2	6	83351	83356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778422

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